El Patronat és l’òrgan de govern, representació i administració de la fundació, que executarà les funcions que li corresponen, amb subjecció al que es disposa en l’ordenament jurídic i en els estatuts de l’Agència.
És patró fundador l’Excel·lentíssima Diputació d’Alacant, sent el seu representant permanent, el President d’esta.
Com a patró adherit està Alacant Natura Xarxa Ambiental de la Província d’Alacant, que contribuïx econòmicament a diferents programes de la fundació així com als gastos generals del funcionament d’esta.